Pierwsze pytanie jakie zadają sobie przedsiębiorcy przed wdrożeniem do firmy programu lojalnościowego to pytanie - ile będzie to kosztowało, a zatem ile wart jest klient, o którego chce zawalczyć firma? Wart jest tyle ile przyniesie on zysków dla firmy. Wartość tą szacuje się poprzez wskaźnik, który nosi nazwę Customer Lifetime Value, czyli wartość klienta w czasie. Dzięki wskaźnikowi Customer Lifetime Value, można przeprowadzić wstępna segmentację i wybór wartościowych klientów, którzy zostaną objęci programem przez systemy lojalnościowe.
Zatem koszt, jaki niesie za sobą program lojalnościowy może być różny. Najważniejsze jest jednak to, że program motywacyjny może być dostosowany do niemal każdego przedsiębiorstwa - zarówno w sposobie działania jak i w kosztach. Na główne koszty wdrożenia i użytkowania systemów lojalnościowych składają się:
- cena kart dla klientów
- cena dzierżawy lub zakupu terminali do kart
- prowadzenie programu
- ceny bonusów i prezentów
- ewentualne przeszkolenie pracowników firmy do kożystania z systemu